心磁图具有类似于心电图的形态特征：P波、QRS波群和T波。一般情况下，它们之间的时间关系也类似于心电图。所有心磁图系统都可测量垂直于前胸(Bz)的磁场分量(径向或z分量)。空间心电图和心磁图模式的主要区别是它们之间的空间角度为90。

　　心磁图对胸部表面的切向电流最敏感，而心电图对径向电流更敏感。 

　　此外，心磁图对闭合（涡流）电流源敏感，这种电流不会引起体表任何电位下降，也不能被心电图检测到。此外，心磁图受身体（肺、肌肉、皮肤）电导率变化的影响小于心电图。心磁图是一种完全无创的方法，避免了心电图中电极接触皮肤的问题。